Dans leur existence, les CUK ont été placées sous l’autorité scientifique de la Faculté de Sciences biomédicales mais ayant une nette autonomie de gestion et dépendant, pour ce faire,  directement du Conseil d’Administration de l’Université. 

Ainsi, les cliniques universitaires de Kalemie organisent les services suivants:

• Pédiatrie
• Medecine interne
• Gynéco obstétrique
• Chirurgie
• Dentisterie
• Laboratoire